Ян Скотницкий родился 20 марта 1933 года в Лодзи.
Закончил сначала факультет польского языка, а затем в 1966 году режиссёрский факультет Варшавской высшей театральной школы.

Проректор Варшавской высшей театральной школы (1971-74).
Один из основателей и директор Драматического театра им. Е.Шанявского в Плоцке (1975-81). В 1997 году избран секретарем Национального театра и занимал эту должность до 2004 года. До выхода на пенсию в 2010 году он поставил около ста спектаклей.

В 1998 году Яну Скотницкому было присвоено звание профессора.
Он ушёл из жизни 5 августа 2013 года в селе Стегна, Поморского воеводства.