Существуют оригами - страшные монстры. А также люди зараженные матаной - полукровки, таким является и Кусанаги, местный супергерой.
Главная героиня "Голубого семени 2" - пятнадцатилетняя школьница Фудзимия Момидзи. Момидзи состоит в секретной японской правительственной организации,"сборная солянка" из специалистов всех областей знании и умении. Все они стоят перед сложнейшими проблемами - по одной на каждую серию.